نشرت الجريدة الرسمية قرار وزير السياحة والآثار الدكتور خالد العناني باعتماد الهيكل التنظيمى الصادر به قرار رئيس الجهاز المركزي للتنظيم والإدارة رقم 62 لسنة 2020 بشأن اعتماد جدول وظائف هيئة المتحف المصري الكبير المعدل بموجب القرار رقم 163 لسنة 2021، والمرفق بهذا القرار.
يتضمن الهيكل التنظيمي لوظائف المتحف رئيس مجلس الإدارة ثم الرئيس التنفيذي تتبعه 8 إدارات عامة هي الإدارة القانونية، والأمن، والمكتب الفني، والإدارة الاستراتيجية والسكرتارية التنفيذية، والعلاقات العامة، والمراجعة الداخلية والحوكمة، والتخطيط الاستشاري.
ويتبع الرئيس التنفيذي للمتحف نائبين أحدهما لشئون الآثار والزوار وتتبعه 3 إدارات عامة هي الإدارة العامة للترميم، والإدارة العامة لخدمة الزائرين، والإدارة العامة للمقتنيات والمعارض.
