وتضمنت مكافآت مكتب رئيس الجامعة، مكافأة على الأجر بنسبة 80%، ومكافأة عائد الصناديق الخاصة، ومكافأة تطوير التعليم ومكافأة ماليزيا، ومكافأة شهر كل شهرين.
وبالنسبة لمكافآت مكتب نائب رئيس الجامعة لشئون التعليم والطلاب، فنص القرار على أنها نفس المكافآت السابقة، باستثناء مكافأة شهر كل شهرين، وبالنسبة لمكافآت مكتب نائب رئيس الجامعة لشئون الدراسات العيا والبحوث، فهى مكافآت الأجر الإضافى بنسبة 80% شهريا، وعائد الصناديق الخاصة، ومكافأت ماليزيا، ومكافأة أخرى من مركز تنمية القدرات.
أما عن مكتب نائب رئيس الجامعة لشئون خدمة المجتمع وتنمية البيئة، فيحصل موظفوه على مكافأتين فقط وهما مكافأة الأجر الإضافى بنسبة 80% شهريا، وعائد الصناديق الخاصة.
بينما نص القرار على أن يحصل موظفو مكتب الأمين العام للجامعة على مكافآت الأجر الإضافى بنسبة 80% شهريا، وعائد الصناديق الخاصة، ومكافأة تطوير التعليم، ومكافأة ماليزيا، إضافة إلى مكافأة شهرية 200 جنيه لمختار أبو السعود من الموازنة (جلسات مجلس الجامعة).
بينما يحصل موظفو مكتب الأمين المساعد للشئون المالية على مكافآت الأجر الإضافى بنسبة 80% شهريا، وعائد الصناديق الخاصة، ويحصل على مكافأة أخرى مميزة عن كل ما سبق تسمى مكافأة رصيد الإنجازات وتقدر بـ"100%" من المرتب شهريا، وهى نفس المكافآت التى يحصل عليها موظفو مكتب الأمين المساعد للشئون الإدارية.
