وتتضمن الآليات إشراف لجنة منتخبة على انتخابات رؤساء الأقسام وأعضاء هيئة التدريس، بينما يختار المجمع الانتخابى لرئيس الجامعة الذى سيتم انتخابه أيضا، لجنة ثلاثية منتخبة من بين أعضائه، وتتم دعوة الناخبين للمشاركة بإخطار من لجنة الإشراف عن طريق كلياتهم، ويتم فرز الأصوات علانية فور انتهاء عملية الاختيار، وعند مشاركة الهيئة المعاونة "المدرسين والمدرسين المساعدين" فى انتخابات رؤساء الأقسام يخصص لهم صندوق انتخابى منفصل، بحيث يدلى الجميع بأصواتهم، ويتم حساب نسبة 10 % من الأصوات الصحيحة.
ولا تتم الانتخابات بالجامعات، إلا على 123 مقعدا من عمداء ورؤساء الجامعات، من بينها 8 رؤساء جامعات من 19 جامعة، فى حين لن تتم انتخابات على عمداء الكليات ورؤساء الأقسام الذين لم تنته مددهم، كما لم يتم حتى اليوم حسم مصير رؤساء الجامعات الذين قدموا استقالاتهم فى جامعات القاهرة وبورسعيد والفيوم وجنوب الوادى.
وتضمنت قواعد انتخاب عميد الكلية ما انفرد به "اليوم السابع" أول أمس بأنه سيتم تعيين عمداء الكليات التى لا يتجاوز عدد الأساتذة 4 وعدد أعضاء هيئة التدريس "الأساتذة والأساتذة المساعدين، والمدرسين" 20 عضوا، وفى حال إجراء الانتخابات يشترط حضور 60 % من أعضاء هيئة التدريس، وغذا لم يكتمل النصاب تؤجل الانتخابات لمدة ساعة بحضور 40 % على الأقل، وإذا لم تكتمل النسبة يحق لرئيس الجامعة تعيين عميد الكلية، وتعاد الانتخابات بين أعلى اثنين إذا لم يحصل أحدهما على الأغلبية المطلقة.
وبالنسبة لانتخاب رئيس الجامعة، فيتم انتخابه بواسطة مجمع انتخابى مكون من عمداء الكليات والمعاهد التى تضمها الجامعة، أو أقدم وكلائها فى حال تقدم العميد للترشح، بالإضافة إلى انتخاب ممثلين للكليات فى المجمع من خلال أعضاء هيئة التدريس بكل كلية، مشيرا إلى أنه سيتم ذلك باختيار عضو واحد للكليات التى يقل عدد أعضاء هيئة التدريس بها عن 20 عضواً، وعضوان للكليات التى يكون بها عدد أعضاء هيئة التدريس ما بين 20 و100 عضو، وثلاثة أعضاء للكليات التى يزيد عدد أعضاء هيئة التدريس بها على المائة عضو.
وتتكفل اللجنة المشرفة على الانتخابات بتحديد أوقات متساوية لندوات المرشحين، ووقت إجراء الانتخابات يتعيين حضور 80 % من أعضاء المجمع الانتخابى، فإذا لم يكتمل النصاب تؤجل الجلسة لمدة ساعة، ويكون انعقادها صحيحا بحضور 60 %، فإذا لم تكتمل النسبة يكون لوزير التعليم العالى اختيار من تتوافر فيه الشروط طبقا للقانون.
ولكن البند المثير للجدل فى قواعد اختيار رئيس الجامعة أنه لا يكفى حصول المرشح لمنصب رئيس الجامعة على أعلى الأصوات، وإنما يكون للسلطة المختصة "رئاسة الجمهورية سابقا، والمجلس العسكرى حاليا"، الحق فى اختيار أحد الثلاثة الحاصلين على أعلى الأصوات وتعيينه رئيسا للجامعة.
